今天宠物迷的小编给各位宠物饲养爱好者分享干扰序列效果分析的宠物知识,其中也会对RNA干扰的RNA干扰主体实验(RNA干扰的诱发因子)进行专业的解释,如果能碰巧解决你现在面临的宠物相关问题,别忘了关注本站哦,现在我们开始吧!
siRNA表达载体构建好后,即可进行RNA干扰主体实验。RNA干扰主体实验的重点在于: 按照nature的标准,一个严格的RNAi介导knockdown实验要有6个对照:⒈转染试剂对照(监控转染及培养条件对结果的影响);⒉nonsense siRNA对照(监控外源核酸本身对结果的影响);⒊positive siRNA对照(监控假*性);⒋技术重复对照(也叫off-target 对照,也就是利用至少2个靶点的siRNA同时实验,2个siRNA互为off-target control,当两者的表型相同时,才有可能是特异性的knockdown效应);⒌rescue 对照(knockdown之后做超表达,看是否有性状的逆转,这也是为了说明knockdown的特异性);6.全表达组扫描对照(就是转录/表达芯片扫描,以最终确定表型不是由于off-target造成)。实际实验中,全表达组扫描对照很少有文献涉及。其它几个对照中,1,2两种对照即所谓的空白细胞对照、NC对照,基本是所有杂志都要求具备的。4,5两种对照,主要是为了解决off-target效应,选做一种即可,一般建议选5,涉及的实验即所谓的“RNA干扰回复实验”, 一般应该从mRNA水平、蛋白质水平、细胞表型水平三个层次来检测干扰效率。mRNA水平:RT-PCR、Real-time PCR;蛋白质水平:Western-blot、ELISA、免疫组化;细胞表型水平:MTT、**形成实验、流式细胞检测、细胞小室实验等。RNA干扰效率在动物模型上的进一步验证(体内) 动物模型实验可以采取“体内法”和“体外法”。体内法,即先做*鼠成瘤模型,再将质粒或**导入*鼠,检测RNA干扰效果。此法操作复杂,对质粒和**产品的质和量要求都较高,但是比较贴近实际,说服力较显著。体外法,即先将质粒或**导入肿瘤细胞,再将肿瘤细胞导入动物体内,然后检测RNA干扰效果。此法操作较简单,对质粒和**产品的质量要求较低,所以为大多数文献所采用。建议采用此方法来进行动物模型水平的实验。
在RNA干扰实验中
首先需要构建dsRNA表达载体
将这种载体导入受体细胞中后
表达产生的dsRNA在DICER酶作用下形成siRNA
引起具有相同序列的mRNA发生讲解
导致细胞或个体不能合成相应的蛋白质
所以个体会表现出功能缺失表型
构建表达载体通常选用dsRNA
需要注意的一些方面是
dsRNA序列中GC的含量要小于50%
高GC含量会降低RNAi的效果
选定的dsRNA序列应通过搜索数据库确保与其他基因无同源性
以避免对其他同源性基因表达的抑制
不同区域的dsRNA具有不同的基因沉默效果
可同时构建两个以上针对同一基因不同靶区域的dsRNA表达载体
还要充分考虑siRNA的结构特征
siRNA与mRNA的同源程度对RNAi有明显影响
启动子区或者编码区与siRNA同源的基因受siRNA抑制
但siRNA在动物细胞中对mRNA的前体没有影响
所以含非编码区序列的dsRNA不会引起RNAi
而且在构建表达载体时
经常使用U6启动子等RNA聚合酶Ⅲ能够识别的启动子序列
最后将其转入到质粒中
这里说的只是一个简单的过程
总的来说构建表达载体是个比较复杂的过程
如果要知道详细的技术
建议还是去看书吧
这里是说不清的
短时记忆的特点
用绿色荧光蛋白(GFP)反映RNA干扰(RNAi)载体的转染率,以研究RNAi载体的抑制效果
(1)物理干扰物理干扰是指试样在转移、蒸发过程中任何物理因素变化而引起的干扰效应。属于这类干扰的因素有:试液的粘度、溶剂的蒸汽压、雾化气体的压力等。物理干扰是非选择性干扰,对试样各元素的影响基本是相似的。 配制与被测试样相似的标准样品,是消除物理干扰的常用的方法。在不知道试样组成或无法匹配试样时,可采用标准加入法或稀释法来减小和消除物理干扰。
(2)化学干扰化学干扰是指待测元素与其它组分之间的化学作用所引起的干扰效应,它主要影响待测元素的**化效率,是**吸收分光光度法中的主要干扰来源。它是由于液相或气相中被测元素的**与干扰物质组成之间形成热力学更稳定的化合物,从而影响被测元素化合物的解离及其**化。 消除化学干扰的方法有:化学分离;使用高温火焰;加入释放剂和保护剂;使用基体改进剂等。
(3)电离干扰在高温下**电离,使基态**的浓度减少,引起**吸收信号降低,此种干扰称为电离干扰。电离效应随温度升高、电离平衡常数增大而增大,随被测元素浓度增高而减小。加入更易电离的碱金属元素,可以有效地消除电离干扰。
(4)光谱干扰光谱干扰包括谱线重叠、光谱通带内存在非吸收线、**化池内的直流发射、分子吸收、光散射等。当采用锐线光源和交流调制技术时,前3种因素一般可以不予考虑,主要考虑分子吸收和光散射地影响,它们是形成光谱背景的主要因素。
(5)分子吸收干扰分子吸收干扰是指在**化过程中生成的气体分子、**物及盐类分子对辐射吸收而引起的干扰。光散射是指在**化过程中产生的固体微粒对光产生散射,使被散射的光偏离光路而不为***所检测,导致吸光度值偏高。
你好,一楼的解释我不同意,因为一楼给出的例子是错的。计量经济学解决异常值问题并不是通过随机扰动项,而是通过扩大样本这种较为直接的方法,即虽然有一两家单月支出较大,但是被茫茫的支出数额较平均的家庭大军所淹没,异常值不会对模型本身产生太大影响。
随机扰动项我习惯称之为随机误差项,包含的是模型主要变量以外的信息。我仍用居民支出举例,如:
Y=aX1+bX2+c+随机误差项..........(1)
Y代表居民支出;X1代表居民收入;X2代表家庭财富;c是常数,即居民基本消费。这时,随机误差项代表的是:GDP、消费者价格指数、工业品价格指数、本币汇率、大宗商品价格指数、房价均值、子女教育费均值等等等等。我们知道,收入和财富是决定居民支出较为直接的变量,所以我们将其引入模型中,而宏观经济情况和价格水平都是间接影响着居民支出的。如果我们需要更详细全面的模型,那么我们需要引入更多的变量;但引入更多变量的成本也较大,比如多重共线、自相关问题等等。所以模型利用随机误差项将该部分庞大而对因变量影响不大的变量们都统一在一起表示,并且由于这些变量们对因变量的影响有正有负亦可相互抵消,只是影响模型的设定全面性而已。虽然如此,任意将模型的变量放入随机误差项也是不对的,比如:上述模型可以改为:
Y=aX1+c+随机误差项..........(2)
我们可以看到,家庭财富被挪入随机误差项,这是可以的,但是模型存在设定偏误,即模型忽略了家庭富足,而收入不高,靠有钱的老爹过着花天酒地生活的人群,而这种人群我们不能证明其是大还是小,就很有可能对模型产生较大影响。好吧,直接公布答案,通过很多学者的研究,在模型(1)中我们得到的那条曲线更真实,所以我们刚才说的那种靠爹吃饭的人还真不是少数。所以模型(2)是有问题的。当然这不证明模型(1)就完全没有问题,模型(1)存在较为严重的多重共线问题,即收入和家庭财富是相关性非常高的。不管他,扯远了,我们是为了解释随机误差项的含义,怎么合理利用需要大量的阅读……
如果你让我从数学式上对随机误差项进行解释,我只能说其期望值是0,方差好像是1,忘记了。刚才说的模型(2)至少就不符合期望值是0的假设,所以模型(2)是有问题的。当然这都是理论的假设前提,在这些前提下,模型是有效的,我们也称之为BLUE,如果前提被破坏,我们就要对模型进行调整和修正以使之回归BLUE的结果。所谓BLUE就是模型符合:无偏性、有效性、一致性。无偏性就是估计值的期望值等于实际值;有效性就是估计值是方差最小的;一致性就是估计值依概率收敛到实际值
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